2024-12-30 18:09:01
近日，西北農(nóng)林科技大學(xué)于太永教授課題組聯(lián)合國內(nèi)外多家單位，在豬泛基因與結(jié)構(gòu)變異研究方面取得重要進展。相關(guān)成果，以題為“Pangenome and genome variations analysis of pigs unveil genomic facets for its adaptation and agronomic characteristics”的學(xué)術(shù)論文形式，發(fā)表于國際知名期刊《iMeta》（IF：23.7）。
豬糧安天下。豬肉是我國居民消費的最主要肉類產(chǎn)品，約占我國居民肉類產(chǎn)品消費總量的57.8%。生豬產(chǎn)業(yè)是我國畜牧業(yè)的支柱，其產(chǎn)值約占總量的45.6%。生豬產(chǎn)業(yè)，是實施農(nóng)業(yè)強國戰(zhàn)略和鄉(xiāng)村振興的重要抓手。我國是養(yǎng)豬大國，但不是養(yǎng)豬強國。生豬養(yǎng)殖科技水平，特別是生豬種業(yè)與國外先進國家相比仍有較大差距。生豬重要經(jīng)濟性狀形成的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和遺傳基礎(chǔ)，仍然不明。近年來，高通量測序技術(shù)和信息技術(shù)迅猛發(fā)展，使得從泛基因組和結(jié)構(gòu)變異角度，解析生豬重要經(jīng)濟性狀和抗逆性狀形成的機制成為可能。
課題組利用27個中西方豬基因組，構(gòu)建了迄今為止包含個體數(shù)最多的豬圖形泛基因組。在此基礎(chǔ)上，對598個個體的全基因組重測序數(shù)據(jù)進行結(jié)構(gòu)變異檢測發(fā)現(xiàn)，結(jié)構(gòu)變異與豬的抗逆性和重要經(jīng)濟性狀的形成密切相關(guān)；分析發(fā)現(xiàn)BTF3是調(diào)控豬肌內(nèi)脂肪沉積的關(guān)鍵基因。此外，還發(fā)現(xiàn)了與豬耐熱耐寒等抗逆性相關(guān)基因，以及調(diào)控豬體型大小的關(guān)鍵候選基因OPA1。該研究，從泛基因組和結(jié)構(gòu)變異維度加深了人們對生豬重要經(jīng)濟性狀和抗逆性狀形成機制的理解。同時，也為利用基因組選擇技術(shù)加快生豬遺傳改良提供了新的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)和支撐。
豬圖形泛基因組和結(jié)構(gòu)變異分析模式圖
該項研究工作，得到了國家科技重大專項2030（2023ZD04044）、國家重點研發(fā)項目（2021YFD1301200）、陜西省農(nóng)業(yè)關(guān)鍵核心技術(shù)攻關(guān)項目（2024NYGG006）和陜西省畜禽育種“兩鏈融合”重點專項（2022GD-TSLD-46）等項目的資助。
全文鏈接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/imt2.257
農(nóng)業(yè)科技報-中國農(nóng)科新聞網(wǎng)記者 胡潤田
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